
前言
上一期我們從理論和實際例子角度介紹了BOIN設計在臨床研究中的作用,以及其相對于傳統3+3設計的優勢。本期,我們簡要介紹如何借助各種軟件來計算獲得我們使用BOIN作為臨床試驗設計過程中需要的參數以及其他數據。
要獲得設計參數以及相關的數據,首選使用安德森癌癥研究中心推出的線上的BOIN suite網站。網址為https://trialdesign.org/one-page-shell.html#BOIN,下面我們簡要的介紹如何進行操作:
(1)首先我們可以利用Trial Setting選項卡填寫劑量組數目,起始劑量級別,每隊列人數,總隊列人數,單劑量組最大入組人數這幾個基礎參數,這些數據應通過前期對藥物本身毒性及特性的了解進行選擇。
(2)下一步即可設定目標毒性概率,應綜合考慮藥物毒性及收益風險關系。如果藥物在低劑量組下被認為是安全的,可以選擇使用加速滴定的設計。如果選擇的隊列人數為3和6的話,也可以選擇合并使用3+3設計,這樣可以與傳統設計更加契合,并且保留了BOIN設計的優勢。
(3)最后則是設置毒性劑量剔除標準,即Pr>Pe(真毒性概率>目標毒性概率的概率>Pe),一般我們把Pe設置為0.95。對于低劑量組的毒性被認為是顯著的藥物來說,可以選擇使用更加嚴格的剔除標準,避免首個劑量組已經超過MTD。另一方面,我們也可以選擇確保MTD下的DLT概率小于我們的劑量降低界值,這一選項會提高試驗的安全性,但是可能會稍微降低MTD的選擇比例(selection percentage)。
如果選擇了更加嚴格的第一劑量組剔除規則的話,還會得到一個試驗終止決策表:
我們還可以通過Simulation選項卡,模擬在不同“真”毒性概率下的試驗參數,并且我們可以同時模擬3+3設計下MTD組入組人數及選擇比例與BOIN設計的差異,更加直觀的了解兩者的差異性。網站基于前面填入的目標毒性概率會自動隨機生成5個不同的“真”毒性概率情景,我們也可以手動更改。
模擬結束后,我們可以得到如下的表格供參考。
完成上面兩個選項卡的操作后,網站在Trial Protocol選項卡中提供了自動生成的試驗方案模板和流程圖供參考。
當試驗全部完成后,我們可以通過Select MTD選項卡,輸入我們試驗獲得的數據,從而得到一個不同劑量水平下MTD的選擇概率。如下圖所示,第三劑量水平的DLT概率最為接近我們的目標毒性概率,故MTD為第三劑量水平。
此工具還有桌面軟件的版本,與在線版幾乎一致,由于軟件可及性的問題,建議使用在線版本。
第一步獲得遞增減少界值,我們可以利用 get.boundary()函數
第二步我們可以像在網上操作那樣,通過模擬預測試驗的一些參數,使用get.oc()函數。
可以發現許多參數與上面的get.boundary()類似,這里不再多說,僅介紹下特有的參數:
同時我們也可以使用summary()或plot()去獲得和網頁版類似的表格和圖表。
當完成試驗后,可以通過select.mtd選擇我們的MTD:
與上面類似,可使用summary()或plot()去獲得和網頁版類似的表格和圖表。
BOIN資源包中同時也包括了設計BOIN comb的函數。使用R進行操作可能會增加難度,但對于有經驗的R語言用戶來說,這種方法可以與其他R資源包結合,使得整個操作過程更加的靈活。加小編微信討論或獲取BOIN資源包手冊。
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