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BOIN設計-如何獲得試驗設計參數

發布時間:2021-12-21 文章來源:本站  瀏覽次數:11532

前言

上一期我們從理論和實際例子角度介紹了BOIN設計在臨床研究中的作用,以及其相對于傳統3+3設計的優勢。本期,我們簡要介紹如何借助各種軟件來計算獲得我們使用BOIN作為臨床試驗設計過程中需要的參數以及其他數據。

方法一

使用線上BOIN設計網站(適合非專業用戶)

要獲得設計參數以及相關的數據,首選使用安德森癌癥研究中心推出的線上的BOIN suite網站。網址為https://trialdesign.org/one-page-shell.html#BOIN,下面我們簡要的介紹如何進行操作:

1.Trial Setting選項卡

(1)首先我們可以利用Trial Setting選項卡填寫劑量組數目起始劑量級別每隊列人數總隊列人數單劑量組最大入組人數這幾個基礎參數,這些數據應通過前期對藥物本身毒性及特性的了解進行選擇。


(2)下一步即可設定目標毒性概率,應綜合考慮藥物毒性及收益風險關系。如果藥物在低劑量組下被認為是安全的,可以選擇使用加速滴定的設計。如果選擇的隊列人數為3和6的話,也可以選擇合并使用3+3設計,這樣可以與傳統設計更加契合,并且保留了BOIN設計的優勢。


(3)最后則是設置毒性劑量剔除標準,即Pr>Pe(真毒性概率>目標毒性概率的概率>Pe),一般我們把Pe設置為0.95。對于低劑量組的毒性被認為是顯著的藥物來說,可以選擇使用更加嚴格的剔除標準,避免首個劑量組已經超過MTD。另一方面,我們也可以選擇確保MTD下的DLT概率小于我們的劑量降低界值,這一選項會提高試驗的安全性,但是可能會稍微降低MTD的選擇比例(selection percentage)。


全部設置完后,即可獲得設計的流程圖及決策表





如果選擇了更加嚴格的第一劑量組剔除規則的話,還會得到一個試驗終止決策表:


2、Simulation選項卡

我們還可以通過Simulation選項卡,模擬在不同“真”毒性概率下的試驗參數,并且我們可以同時模擬3+3設計下MTD組入組人數及選擇比例與BOIN設計的差異,更加直觀的了解兩者的差異性。網站基于前面填入的目標毒性概率會自動隨機生成5個不同的“真”毒性概率情景,我們也可以手動更改。

模擬結束后,我們可以得到如下的表格供參考。


完成上面兩個選項卡的操作后,網站在Trial Protocol選項卡中提供了自動生成的試驗方案模板和流程圖供參考。

3、Select MTD選項卡

當試驗全部完成后,我們可以通過Select MTD選項卡,輸入我們試驗獲得的數據,從而得到一個不同劑量水平下MTD的選擇概率。如下圖所示,第三劑量水平的DLT概率最為接近我們的目標毒性概率,故MTD為第三劑量水平。


此工具還有桌面軟件的版本,與在線版幾乎一致,由于軟件可及性的問題,建議使用在線版本。

方法二

使用R語言(適合專業用戶)

考慮到使用R語言的門檻。此處僅為簡要介紹。

在R中使用BOIN設計需要首先獲得并引用資源包


第一步獲得遞增減少界值,我們可以利用 get.boundary()函數


舉個例子比如


第二步我們可以像在網上操作那樣,通過模擬預測試驗的一些參數,使用get.oc()函數。


可以發現許多參數與上面的get.boundary()類似,這里不再多說,僅介紹下特有的參數:


同時我們也可以使用summary()或plot()去獲得和網頁版類似的表格和圖表。

當完成試驗后,可以通過select.mtd選擇我們的MTD:



與上面類似,可使用summary()或plot()去獲得和網頁版類似的表格和圖表。

BOIN資源包中同時也包括了設計BOIN comb的函數。使用R進行操作可能會增加難度,但對于有經驗的R語言用戶來說,這種方法可以與其他R資源包結合,使得整個操作過程更加的靈活。加小編微信討論或獲取BOIN資源包手冊。

交流熱線

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